肿瘤负荷如何计算

肿瘤

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airbike

2023-05-28 08:58

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肿瘤负荷(Tumor Mutational Burden,TMB)是指在肿瘤细胞中发现的所有非同义突变的数量,通常用来衡量肿瘤基因组的突变程度。

计算TMB的方法基本上有两种:

1. 基于外显子组测序的方法

高通
高通

肿瘤组织中提取DNA,使用高通量测序技术对多个外显子区域进行测序,计算其中的非同义突变数,从而得出TMB值。

2. 基于全基因组测序的方法

肿瘤组织中提取DNA,进行全基因组测序,计算非同义突变数并对基因组大小(如大肠杆菌基因组大小)进行标准化,从而得出TMB值。

需要注意的是,由于不同样本的上述测序方法、数据分析和准确性等因素会影响TMB的计算结果,因此不同实验室、不同研究中TMB值的具体计算方法可能有所不同,而TMB的计算方法也在不断发展和完善中。

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