抵扣联认证是指将多个企业的增值税发票联合认证，以减轻企业的开票和认证负担，提高发票使用效率，促进增值税发票流通。抵扣联认证后，企业需要进行以下处理：
1. 核对认证发票：确定是否有漏认证发票或重复认证的情况，及时处理。
2. 更新账簿记录：将认证后的发票信息及时录入账簿，并更新账目记录。
3. 汇总纳税申报：对认证后的发票进行汇总，以便后续进行纳税申报。
4. 保留相关证据：企业应妥善保存抵扣联认证相关证明材料，以备税务机关审核。
需要注意的是，抵扣联认证后仍然需要遵守税法规定，如避免超过允许的进项税抵扣比例等。
