When I run,she_____ (run) , too.填will run行不行。

你可以说“当我跑步时，她也会跑步。”这里的“也会”可以代替“will run”来表达将来时态，表示在某个特定的情况下，她会与你一起跑步。这样的表达方式在中文里更为自然和流畅。