预付款在最后两个月扣除，每月扣50%，试计算该市政工程的工程预付款及扣回金额。

为了计算该市政工程的预付款及扣回金额，我们首先需要知道工程的总金额。假设工程的总金额为X元。

根据您的描述，预付款在最后两个月各扣除50%，这意味着预付款的总扣回金额等于预付款的全部金额。也就是说，预付款在最后一个月和前一个月各被扣回了工程总金额的25%。

因此，预付款的计算方式可以是这样的：

1. 工程预付款 = X元 * 50% = 0.5X元 2. 最后一个月扣回的金额 = 预付款的50% = 0.5 * 0.5X元 = 0.25X元 3. 前一个月扣回的金额 = 预付款的50% = 0.5 * 0.5X元 = 0.25X元

所以，工程的预付款为工程总金额的50%，即0.5X元，而在最后两个月中，每月都会被扣回预付款的50%，即0.25X元，总共扣回0.5X元，正好是预付款的全部。

请注意，这里的X是一个变量，代表工程的总金额，实际计算时需要将X替换为具体的工程总金额数值。