付款按合同3%金额付款，收回来的发票是1%，他们收2个点，我们账上要怎么处理的

合同

在处理这种情况时，首先需要确认合同中的条款是否允许对方以低于合同约定的税率开具发票。如果合同中明确规定了税率，并且对方开具的发票税率低于合同约定，这可能涉及到合同条款的修改问题或者税务合规的问题。

你可以采取以下几个步骤来处理这种情况：

1. 沟通确认：首先与对方进行沟通，了解他们以1%税率开具发票的原因。可能是对方为了某些税务筹划或者误解了合同条款。

发票

2. 法律咨询：如果对方无法给出合理的解释或者无法按照合同约定开具发票，建议咨询法律专业人士，了解在这种情况下应该如何操作。

3. 税务咨询：同时，也建议咨询税务顾问，确认以低于合同约定的税率开具发票是否符合税务法规，以及可能的税务风险。

4. 账务处理：在确保所有条款和税务规定都得到遵守的情况下，可以按照实际收到的发票金额进行账务处理。但是，需要注意的是，这种处理方式可能会影响企业的财务报表和税务申报。

5. 合同变更：如果合同确实需要修改，可以与对方协商修改合同条款的细节，包括税率等，并且保证修改后的合同对双方都有约束力。

6. 记录存档：无论采取哪种处理方式，都需要做好详细的记录和证据存档，以备日后审计和审查。

请记住，处理此类问题时应遵循合同条款和法律法规，确保企业的财务和税务合规。