公司
可以凭
公司保留的协议书要回经济补偿金。只是在取证上，需要走一些程序。第一、你母亲可以先去
公司领钱，如果
公司不给，或者
公司要求凭协议书领钱的话，再进行下一步：第二、如果出现纠纷，可以到劳动仲裁委提起仲裁，在举证方面，可以保留其他员工的协议书复印件和证人证言，用以证明你母亲和
公司签订过类似协议。而且，解除劳动关系事实，
用人单位应负举证责任，可以请求仲裁庭责令
用人单位提供解除劳动关系协议书。所以，一方协议书的丢失，并不能使法律事实或法律关系无效。你母亲仍可要回自己的经济补偿金。
