我买的水货C6，到现在才3个月，触摸屏就没反应了，拿到卖家那儿就说只保主板，这是合理的吗？

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这是不合理的。首先，你购买的C6才三个月就出现触摸屏没反应的问题，这很明显是产品质量或者手机本身存在隐患。卖家说只保主板，这完全是一种逃避责任的行为。水货手机的保修虽然可能会有一些特殊情况，但在没有特殊约定的情况下，整个手机的正常使用部件都应该被纳入保修范围。你可以多搜集一些关于这个手机故障的证据，例如故障发生时的视频或者照片等，然后再去和卖家协商，要求他对触摸屏进行保修，如果协商不成，也可以考虑通过其他途径来维护自己的权益。