小规模纳税人时期已经按1%的税率确认收入成本并申报了增值税，一般纳税人时期按6%税点开票收款

增值税

在小规模纳税人时期，企业按照1%的税率确认收入成本并申报了增值税，而当企业转为一般纳税人后，按照6%的税率开具发票并收款。这种情况在实际操作中需要注意几个方面：

1. 税率调整：从1%变为6%，这会对企业的税负产生影响。需要确保所有的税务处理符合税法规定，尤其是在转换期的处理上。

2. 会计处理：企业需要在会计账目中反映税率的变化。一般情况下，需要对转换期间的收入和成本进行相应的调整，以确保账目的一致性和准确性。

一般纳税人

3. 发票管理：转换为一般纳税人后，企业需要使用增值税专用发票或普通发票，具体取决于购买方是否需要抵扣增值税。需要确保发票的开具和管理符合税务机关的要求。

4. 进项税额抵扣：一般纳税人可以抵扣进项税额，这有助于降低企业的实际税负。需要注意的是，只有合法有效的增值税专用发票的进项税额才可以抵扣。

5. 税务申报：需要根据新的税率和相关规定进行税务申报，确保提交的资料准确无误。

6. 财务规划：考虑到税率的变化，企业可以调整自己的财务规划和定价策略，以应对新的税法环境。

企业在进行上述调整时，建议咨询专业的税务顾问或会计师，以确保所有的操作都符合税法的规定，避免潜在的税务风险。